Hur man beräknar mutationshastigheter

Författare: Mike Robinson
Skapelsedatum: 16 September 2021
Uppdatera Datum: 18 April 2024
Anonim
Hur man beräknar mutationshastigheter - Vetenskap
Hur man beräknar mutationshastigheter - Vetenskap

Innehåll

Mutationshastigheten är chansen att en nukleotid utelämnas eller förändras i DNA orsakad antingen av naturliga fel i DNA-bearbetning (spontan mutation) eller av externa medel (inducerad mutation). Denna hastighet bör inte förväxlas med mutationsfrekvensen, vilket är antalet mutationer i en given generation. Mutationshastigheten för en viss art extrapoleras vanligtvis från data, där alla DNA-sekvenser i ett tvärsnitt av arter jämförs med deras efterkommande. I laboratoriet görs detta vanligtvis genom att isolera ett urval av arter och låta dem multiplicera över flera generationer.

Beräkning av artsmutationshastigheten

Steg 1

För att underlätta processen, få en provgrupp av hermafroditarter (som befruktar sina egna ägg och inte behöver partners) som häckar snabbt och för vilka du kan reproducera levnadsförhållanden i ett laboratorium. Caenorhabditis Elegans är en liten art av rundmask som uppfyller dessa kriterier och har testats med avseende på dess mutationshastighet tidigare.


Steg 2

Sekvensera och registrera DNA för din art.

Steg 3

Isolera så många individer av olika arter som möjligt för dig att hantera, underhålla och observera under en lång tid under förhållanden under vilka det är känt att varelsen trivs. Detta minimerar effekten av naturligt urval genom att minska ditt genetiska prov.

Steg 4

Håll endast en avkomma för varje generation av arter.

Steg 5

Låt så många generationer som möjligt uppstå och dö, och notera exakt hur många generationer som gått för varje släktlinje.

Steg 6

Ta ett slumpmässigt eller fullständigt DNA-prov från din slutliga avkomma och jämför det med sekvensen för den ursprungliga arten. Räkna antalet ändringar.

Steg 7

I slutet av ditt experiment, använd följande ekvation för att beräkna mutationshastigheten för din art: µ = m / (L x g x b)

där: µ = mutationshastighet m = antal observerade mutationer L = antal experimentella stammar g = genomsnittligt antal generationer b = antal sekvenserade baspar